如果婴儿出生后24小时内即出现黄疸且迅速加深，消退后再次复现，或持续不退，进行性加重等，均属病理性黄疸。较常见的病症有：
1．新生儿溶血症。此病是由于母子血型不合而引起的免疫性溶血，较常见的有Rh血型不合，ABO血型不合。Rh溶血症发病特征大多于出生后24小时内即出现黄疸，呈进行性加剧，肝脾肿大，贫血，严重者可出现全身性浮肿，心力衰竭。如不及时治疗易转为核黄疸。核黄疸的早期症状为厌乳、腹泻、呕吐、嗜睡、尖叫、肢体强直、拥抱反射消失等。ABO溶血病患儿黄疸出现稍晚，进展较慢，贫血及肝脾肿大均不很明显。
2．新生儿败血症及其他严重感染。由宫内、分娩过程中或产后的细菌感染均可引起新生儿败血症。细菌性感染引起的新生儿败血症的黄疸多在出生后一周末出现或加剧，其典型症状有不规则发热、厌食、腹胀、惊厥、肝脾肿大等。
3．新生儿阻塞性黄疸。新生儿阻塞性黄疸的主要原因是先天性胆道闭锁。其特点是持续性黄疸，在生理性黄疸过后仍持续不退，或于生后一周甚至数周后才开始出现并逐渐加深。开始时，哭声、食乳等一般状况如常，以后出现厌食、体重下降，大便呈陶土色或白色，尿色深黄，精神萎靡不振。
4．新生儿肝炎。引起新生儿肝炎的病因较多，多数由病毒引起。起病较缓，常于生后数天至数周内出现黄疸，逐渐加深，持续不退，同时伴有食欲低下、恶心、呕吐、腹胀或消化不良、精神不振等症状，肝脾肿大比较明显。
除此之外，由于窒息与缺氧，头颅血肿或其它部位出血，饥饿、药物等均可导致新生儿黄疸加重。
